Yokoi a été appelé au service actif par l’armée japonaise en 1941. Au départ, a été initialement servi avec la 29ème division d’infanterie à Manchukuo. En 1943, ils l’ont transféré au 38e régiment, éminente dans les îles marianes dans le cadre de l’équipe d’approvisionnement.
Il est arrivé à Guam en février 1943. Lorsque le Corps maritime des États-Unis a capturé l’île pendant la Deuxième bataille de Guam, Yokoi entra dans la jungle avec dix autres soldats japonais se transformant en exploitant (fugitif). Yokoi et ses compagnons ont ignoré les appels de la cession car certaines patrouilles américaines étaient souvent chassées et assassinées ceux qui l’ont fait. En outre, la chute de prisonniers était un déshonneur.
Le sergent Yokoi est resté caché jusqu’en 1972. Sept de l’armée originale ont finalement disparu. Seulement trois restés dans la région. En 1952, il écoutait des rumeurs que la guerre était finie, mais ils pensaient que c’était une Artimaña de les faire sortir et de les assassiner. Plus tard, ces trois derniers derniers séparés et se sont rendus jusqu’à 1964, lorsque Yokoi a trouvé ses deux amis morts, à cause de la famine. Les huit prochaines années vivaient totalement seules.
Yokoi vivait de la chasse et de la pêche, surtout la nuit. Il a utilisé des plantes indigènes pour fabriquer des vêtements, des linge de lit et des ustensiles de rangement, ce qui s’est attiré soigneusement dans sa grotte située près des cascades Talafofo.