Sua família atravessou a fronteira interaleman em 1981 e se estabeleceu na Califórnia. Seu pai, Naimul Karim, é um pesquisador de Bangladesi que atualmente está trabalhando na 3m da empresa dos EUA. Sua mãe, Christine Karim, é um professor alemão e cientista, pesquisado em busca de bioquímica na Universidade de Minnesota.
Karim e sua família emigraram para os Estados Unidos em 1992. Ele se formou no Instituto Central de São Paulo , Minnesota. Ele continuou seus estudos na Universidade de Illinois em Urbana – Champaign, para finalmente deixar o campus antes da formatura para ser empregado pelo PayPal.
trabalhando no PayPal, ele conheceu Chad Hurley e Steve Chen. Os três depois, fundamentaram o site de vídeos do YouTube. Ele mesmo estrela o primeiro vídeo que subiu no YouTube em 24 de abril de 2005. Após a co-fundamento da empresa, Karim optou por participação em tempo integral e atuou como um conselheiro do Youtube. Então ele se matriculou como estudante de pós-graduação em ciência da computação na Universidade de Stanford.