Les limites entre les procaryotes, les eucaryotes unicellulaires et les eucaryotes multicellulaires sont accompagnés de réductions d’ordonnances de la taille de la population efficace, avec des amplifications simultanées des effets de la dérive génétique aléatoire et mutation (1). La baisse résultante de l’efficacité de la sélection semble être suffisante pour influencer une large gamme d’attributs au niveau génomique de manière non rénovée (2). Une question restante clé concerne la mesure dans laquelle la variation de la puissance de la dérive génétique aléatoire est capable d’expliquer la diversité phylogénétique aux niveaux subcelluleux et cellulaires (2-4). Si cela devrait être le cas, la taille de la population devrait être considérée comme un déterminant potentiel des voies mécanistes responsables de l’évolution phénotypique à long terme. Nous démontrons ici une relation inverse phylogénétiquement large entre le pouvoir de la dérive et l’intégrité structurelle des sous-unités de protéines. Cela conduit à l’hypothèse selon laquelle l’accumulation de mutations légèrement délétères dans les populations de petite taille induit la sélection secondaire pour les interactions protéique-protéine qui stabilisent les fonctions de gènes de clé. Ainsi, bien que les architectures de protéines complexes et les interactions puissent être des contributeurs essentiels à la complexité phénotypique, ces caractéristiques peuvent initialement émerger par des mécanismes non accumulés.