Dedicado á música desde a infancia, a partir de 1902 convértese nunha das figuras do lupanares de moda da cidade e desenvolveuse desde entón unha carreira musical caótica e unha vida desordenada que, porén, non o fixo inflúe no seu talento. En 1920 atopámolo en Chicago e, ao ano seguinte, en Nova York. Partiu, entre 1912 e 1922 viaxa a toda a América do Norte cantando e xogando o piano. Ese ano volve a Chicago e forma unha banda, gravando os seus primeiros discos en solitario ou xunto ao rei Oliver. Será entre 1926 e 1930 cando chega ao cenit do seu éxito, xunto cos seus pementões vermellos, que incluían Kid Ory, Johnny Dodds, John Saint-Cyr, rede Allen, Dodds de Babby e outros músicos moi vinculados a Nova Orleans.
Morton mantivo o seu concepto de arranxos baseados en improvisacións polifónicas colectivas, forte alento quente, mesmo na década de 1930, cando todas as orquestas traballaron cos arranxos por seccións típicas das grandes bandas de swing. Dispoñendo á banda a 1930, convértese nun pianista esporádico de clubs escuros, ata que Alan Lomax volveu a desencadear a un Washington Local e, xa en 1938, fai que as valoradas gravadas da Biblioteca do Congreso, o primeiro de 1930. Nos seus últimos dous Anos de vida, montou unha banda, con reducido éxito, a pesar de ter músicos como Sidney Bechet, Wellman Braud ou Zutty Singleton, e con quen fixo varias gravacións baixo o nome de Nova Orleans Jazzmen.
como cantante Tiña unha voz avanzada e estridente, cunha frase rica e imaxinativa, con recursos como o tiro ou a Bocquiusa, é dicir, cantando coa boca pechada. Como compositor, un gran número de obras convertéronse en clásicos de jazz: King Porter Stomp, Wolverine Blues, Kansas City Stomp … na composición, manexou os recursos tradicionais e populares, especialmente os blues, os trapos e os Stomps.