A més de les pròpies barreres físiques epitelials el sistema immunitari és el responsable de la defensa de l’organisme i comprèn el sistema immune innat i el sistema immune adaptatiu. El suposa la primera línia defensiva immunològica davant la qual s’enfronten els microorganismes i antígens estranys i està integrada per macròfags, neutròfils, cèl·lules dendrítiques presentadores d’Ag (CPA), components de l’complement i limfòcits NK (natural killer). Quan aquests els agents infecciosos aconsegueixen sobrepassar aquesta defensa es troben amb el sistema immune adaptatiu que actuant en estreta col·laboració amb el sistema immune innat, genera una resposta molt més específica, ràpida i selectiva davant d’una gran quantitat de diferents Ag, i que al seu vegada es compon d’una resposta humoral formada pels LB productors d’Ac o Ig (Ig G, Ig M, Ig A, Ig e) i resposta cel·lular formada pels LT (LTCD4 + o cooperadors i LTCD8 + o citotòxics).
És fonamental conèixer que tota aquesta complexa xarxa defensiva no es mostra aïllada entre si sinó que hi ha una intercomunicació cel·lular permanent i mantinguda a través de molècules que actuen com a missatgers químics (citoquines, interleucines, interferó, etc.) i de l’existència de múltiples receptors de superfície o lligands específics per a cada antigen o molècula estranya. I el més notable és que funcionen sense que nosaltres donem cap ordre. Per això és tan important realitzar anàlisis hematològiques, estudi microscòpic dels frotis sanguinis, de la medul·la òssia i òrgans limfoides per interpretar aquesta informació que ens aporta el sistema immunitari.