Els dos majors grups de varietats d’arròs, indica i japonica, es van domesticar per l’home de forma independent, a partir d’una única espècie silvestre, Oryza rufipogon, a Àsia, fa uns 9.000 anys, segons un NOU estudi filogeogràfic sobre l’origen de l’arròs.
Fins ara existia un ampli consens sobre que el cultiu de l’arròs va començar en una àmplia zona que comprèn l’est de l’Índia, Indoxina i el sud de la Xina, però no existia consens sobre si l’arròs indica i el japonica eren dos domesticacions independents o ambdues provenen de l’arròs domesticat .
l’arròs indica és el que es correspon normalment amb el tipus de gra llarg, més solt i consistent; mentre que l’arròs japonica és el de tipus de gra mitjà i rodó.
Després d’una anàlisi genètic de l’espècie ancestral i els diferents tipus d’arròs s’ha conclòs que l’arròs indica es va domesticar a la zona de l’Himàlaia , est de l’Índia, Birmània o Tailàndia, mentre que el japonica procedeix d’una altra domesticació independent succeïda al sud de la Xina.