Tant Cales com la seva esposa eren protestants. França era un país majoritàriament catòlic i el catolicisme era la religió de l’Estat. En la seva època, la dura repressió de l’protestantisme iniciada pel rei Lluís XIV amb la revocació de l’edicte de Nantes havia començat a cedir, però els protestants, com a molt, només eren tolerats.
Louis, un dels fills de Cales, es va convertir a l’catolicisme en 1756. Entre el 13 i 14 d’octubre de 1761, el primogènit de Cales, Marc-Antoine, va ser trobat mort a la planta baixa de la residència familiar.
A l’interrogar la família, a el principi van declarar que havia estat assassinat per un lladre. Més tard assegurarien que van trobar a Marc-Antoine penjat. Atès que l’Església considerava el suïcidi com el més detestable crim contra un mateix, i el cadàver de l’suïcida era ultratjat, van disposar les coses perquè la mort del seu fill semblés un estrangulament a conseqüència d’un robatori.
segons els rumors, Jean Cales hauria assassinat el seu fill a l’assabentar-se que, també ell, pretenia convertir-se a l’catolicisme. Sense indagar realment si aquesta havia estat la intenció de Marc-Antoine, se li va declarar màrtir i se li va sepultar d’acord amb el ritu catòlic, i es va acusar el pare d’assassinat.
El 9 de març de 1762 , el Parlament de Tolosa va sentenciar a Jean Cales a morir a la roda. El 10 de març es va executar la sentència i va morir clamant la seva innocència. Després de la roda, se li va estrangular i el cadàver va ser cremat a la foguera.
La mateixa sentència va condemnar a l’exili a Pierre, un altre dels fills de Jean Cales, va ordenar que es tanqués en un convent als seus dos germanes i va confiscar els béns de la família.