Va néixer a Los Angeles, Califòrnia, però a l’edat de dos anys va ser portat i criat a Hawaii. És fill de Sylvia i Robert Lee, un conductor d’autobús. Té tres germans i una germana. És d’origen xinès-hawaià. Pertany a la tercera generació de xinesos-americans.
A mitjans de la dècada de 1990, Lee va interpretar alguns papers importants en llargmetratges. L’ascensió de Lee respon, a més, a un ressorgir de l’gènere d’aventures exòtiques i a una clara revalorització dels orientals a la pantalla. Gràcies a la seva impressionant forma física, fruit de la seva afició a l’surf, va guanyar el paper de Drac després que li rebutgessin en L’últim mohicà (1992), perquè no tenia l’aspecte d’amerindio. Així, l’actor va fer el salt a la fama l’any 1993 de la manera més tòpica, encarnant el mític mestre de les arts marcials i lluitador Bruce Lee a Drac: La història de Bruce Lee. Encara que tenia poc o cap semblança amb la llegenda de l’Kung Fu i cap entrenament previ en arts marcials, va aconseguir capturar les característiques i gestos personals de Bruce Lee i el va convertir en una figura romàntica.
Va tenir un dur treball per davant, mostrar l’essència de l’Jeet Kune Do. Per a això es va entrenar amb Jerry Poteet, que va estudiar durant tres anys amb el mestre de l’Jeet Kune Do, Bruce Lee, i de qui va arribar a ser un gran amic. D’aquesta manera Jerry Poteet lògicament es va convertir en tutor de Jason Scott Lee (sense relació familiar amb Bruce Lee) .Gran part del seu temps junts ho van dedicar a revisar l’estil de Bruce Lee i als seus moviments bàsics de peus, així com els millors mètodes per esgrimir el nunchaku. No va presentar un gran repte, diu Jerry Poteet, perquè Jason era tan atlètic que, naturalment, va arribar a la realització de totes les escenes d’arts marcials.
Des de llavors, no s’ha baixat de les llistes de l’èxit, però segueix rebent tot tipus de papers per a tot tipus d’actuacions. La seva creació de Bruce Lee va impressionar tant a director Stephen Sommers que no va dubtar a oferir-li el paper protagonista d’El llibre de la selva: l’aventura continua (1994), a què fins ara només havia donat vida l’actor indi Sabu el 1944. Jason va aconseguir representar l’espiritualitat inherent i la personalitat de Mowgli.
Actualment viu a la Illa Gran de Manua Loa a Hawaii, a prop de el Parc nacional dels Volcans, en una granja d’estil sostenible de 25 acres de terra envoltada de boscos natius. Lee ha cridat a la seva granja “Pu Mu”, representat per dos caràcters xinesos que simbolitza “Pu” 普 “Simplicitat” i “Mu” 萬畝 “Res”, basant-se en la filosofia i ideologia de portar una vida més senzilla i amb menys possessions materials.
Jason té cura la seva granja utilitzant només els mètodes naturals de l’agricultura tradicional xinesa. Una tècnica desenvolupada pel seu mestre d’agricultura japonesa, Sensei Masanobu Fukuoka.Ha creat un art en l’agricultura que és el més proper a el patró de creixement natural dels cultius, una manera semi-salvatge. Una forma d’agricultura i una forma de vida, que curen l’esperit humà i la terra a el mateix temps. la cura de la terra, és fonamental en Pu Mu.
Jason no està sol a la granja. sovint també el visiten hostes, qualsevol persona, agricultors interessats, així com nens de primària i estudiants de l’escola secundària per a veure el que està passant allà. El documental ” Living Pono “va ser gravat l’1 d’octubre de 200 7 i va ser emès per la televisió a nivell internacional i en festivals internacionals de cinema a partir de 2009.
També és propietari de Teatre Ulua en Honolulu, que es va inaugurar el 2005, amb la producció de l’obra “Burn This” i on a més es realitzen concerts de música d’origen hawaià, en els quals participen entre d’altres la controvertida banda, Sugah Daddy e’Hawaiianrockband.
Llegeix se sent limitat artísticament per la seva aparença física. Com tots els actors de tipus racial, estarà sempre limitat als personatges exòtics. Com un actor no caucàsic amb una aparença ètnica ambigua, ha estat cridat a representar diferents races com ara interpretant a un esquimal a Creador of the Human Heart (1993), un nadiu polinesi de l’Illa de Pasqua a Rapa Nui (1994) i un indi en el Llibre de la Selva.
Lee és un dels actors, productors i directors que van intervenir en el documental The Slanted Screen (2006), dirigida per Jeff Adachi, sobre la representació dels homes asiàtics i asiàtic-americans a Hollywood al llarg de el temps.